6	↓でもおどろ山のセレクト隊は一応弱体化・・というよりＧＢ版が辛すぎる・・。（２対３の勝負の上に自分はろくに機能しないアンチエアくらいしか有効な手がなく。相手は大抵重装甲）　今作では、アンチエアもちゃんと機能し、敵も防御系のパーツを使わないので
5	クワガタverだと相変わらず序盤おどろ山で戦うシオカラのアビスグレーターが鬼畜。まあ事前にアンチシーパーツを入手できる機会はあるものの…。個人的にゴッドエンペラーはラスボスとして戦う時だけ能力強化、とかでもよかったと思う。
4	絵が全部アニメ版になってる。ほるま版の怪しげな絵も好きだったのだが…。
3	毎度の事ながら、カブトとクワガタの２バージョン。
2	とりあえず、ラスボスが以前より弱体化してその他のボスが強くなってるように感じる（クワガタ）
1	ＧＢ、ＧＢＣで発売されたメダロット２のＧＢＡ移植版。内容はＧＢ版と変更はないが、オリジナル要素が追加されている。コミックボンボン（講談社）２００２年１０、１１月号についている申し込み用紙がないと入手できない（ポケモン青と同じ方法になる）。 （ＭＡＫＯ）